Por estar situado na região central do Brasil, o Laboratório de Ecossistemas da Universidade de Brasília atua majoritariamente em ecossistemas de água doce situados no Cerrado. Considerado o berço das águas, o Cerrado abriga oito das dez principais bacias hidrográficas brasileiras. Apesar de sua nata importância para a preservação das águas do Brasil, muitas de suas nascentes e cursos d’água estão sofrendo grandes impactos antrópicos, sejam eles decorrentes de mudanças no uso do solo, construção de hidroelétricas, superexploração de recursos ou eutrofização dos corpos d’água. O laboratório atua principalmente em temas que tangem a biogeoquímica, interações tróficas e efeitos ecossistêmicos das dinâmicas dos organismos aquáticos.
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